为挖掘和利用重穗型骨干亲本中的优良等位基因，李仕贵教授团队联合中科院遗传与发育研究所梁承志团队近期在《Nature Communication》上发表了一套近乎完整的蜀恢498基因组序列，其中12条染色体中有7个完整染色体序列，完整度高于目前水稻日本晴MSU7和拟南芥TAIR10参考基因序列。同时结合实验，全基因组高质量地组注释了蛋白编码基因。蜀恢498基因组序列和蛋白编码基因注释的完成，不仅有利于以蜀恢498为代表的重穗型杂交稻骨干亲本中优异等位基因挖掘和利用，也将会作为籼型水稻参考基因组序列，为整个籼稻优异等位基因的挖掘和利用提供高质量参考序列。
李仕贵教授团队早在10年前就开始着手构建了以蜀恢498为基础的一系列重组自交系、片段代换系以及突变体库等遗传材料。这些材料的获得以及蜀恢498参考基因这一有利工具的完成，为进一步挖掘重穗型杂交稻骨干亲本的关键基因和其他骨干亲本的优良等位基因，研究其遗传机理提供了坚实的基础。
据悉，我校周开达院士针对西南稻区“寡日照、高湿度、小温差”的生态条件，提出了重穗型杂交稻育种思路，经过几代人的研究和探索，目前重穗型杂交稻被证明是提高西南稻区水稻产量的重要途经。李仕贵教授团队通过对已经育成的杂交稻亲本及所配杂交稻组合的株叶形态、光合效率、物质转运和产量构成因素的比较分析，确定以提高杂交稻恢复系千粒重和单穗重为重点，选育出了以蜀恢498为代表性的系列重穗型杂交稻骨干亲本，自2007年以来组配出通过国家或省级审定的杂交稻新品种二十余个,其中F优498被农业部认定为超级稻，现也为长江上游国家区试对照品种，目前正大面积推广应用，取得巨大的社会经济效益。
论文链接：https://www.nature.com/articles/ncomms15324